Инициатива создания ФССОБ принадлежит Председателю Попечительского совета Фонда М.В. Слипенчуку, который озвучил концепцию будущего некоммерческого проекта 20 декабря 2007 года. А уже 7 апреля 2008 года Фонд, основными задачами которого стали поддержка  научно-исследовательских проектов, направленных на сохранение озера Байкал и содействие разработке новейших экологических технологий, получил Свидетельство о регистрации.
За прошедшие с начала официальной деятельности пять лет активными партнерами Фонда стали многие известные ученые, политики, общественные деятели. За бесспорные заслуги в научной деятельности и экологическом просвещении ФССОБ избран первым в истории коллективным членом Русского географического общества. Общественное, профессиональное и международное признание выражено в десятках дипломов и благодарстей, которые получил Фонд.     
За эти годы было реализовано несколько десятков масштабных проектов федерального и международного значения. Помимо знаменитого международного научного трехлетнего  экспедиционного проекта «Миры» на Байкале», организованного ФССОБ при поддержке РАН и партнерстве РГО, было проведено еще несколько научных экспедиций на севере Байкала, в бассейне реки Селенга, Кругобайкальская гидрографическая и зимняя биологическая, ряд комплексных студенческих экспедиций.
При поддержке и участии Фонда организованы и проведены десятки экологических акций  в Байкальском регионе: от ежегодных уборок мусора в Улан-Удэ на День Байкала, Прибайкальском и Кабанском районах Республики Бурятия - до многотысячных акций «Чистый лед Байкала» и Благотворительного экологического марафона «Сохраним Байкал всем миром!» на центральном стадионе Бурятии. Ежегодно при поддержке ФССОБ работают экологические лагеря на Северном и Центральном Байкале.
Десятки российских и международных выставочных проектов о Байкале, организованных Фондом с успехом прошли в Москве, Санкт-Петрбурге, Улан-Удэ, Иркутске, Владивостоке, Новосибирске, Улан-Баторе, Рио-ди-Жанейро, Париже, Монте-Карло, Женеве, Праге и других городах. Организованы несколько международных научно-практических конференций и форумов в России, Франции, Монако, Монголии  и других странах.
Информационный портал ФССОБ лидирует среди научных и образовательных ресурсов о Байкале На этой популярной интернет-площадке собран уникальный научный материал, проведен всероссийский конкурс «100 чудес Байкала», готовится голосование "Знаменитые люди Байкала».
ФССОБ выпустил в свет сборники научных статей "Рациональное природопользование: традиции и инновации", «Патомский кратер», «Байкал – всемирное сокровище» и «Планета Байкал» (на двух языках). На трех кинофестивалях в конкурсной программе принял участие фильм ФССОБ «К глубинам Байкала».

Поздравляем всех наших друзей и партнеров с пятилетием Фонда содействия сохранению озера Байкал!